สํานักงานตั้งอยู่ในส่วนภูมิภาค ปฏิบัติงานขึ้นตรงต่อกรมทางหลวง กระทรวงคมนาคมก่อตั้งขึ้นเมื่อ พ.ศ.2530 เดิมเรียกว่า เขตการ ทางสกลนคร ต่อมาในปี พ.ศ.2534 ได้เปลี่ยนชื่อเป็น สํานักงานทางหลวงที่ 3 (สกลนคร) ปี พ.ศ.2538 เปลี่ยน ชื่อเป็นสํานักทางหลวงที่ 3 (สกลนคร) และในปี พ.ศ.2558 ได้เปลี่ยนชื่อเป็นสํานักงานทางหลวงที่ 3 (สกลนคร) ตั้งอยู่ที่ 1900 ตําบลธาตุเชิงชุม อําเภอเมือง จังหวัดสกลนคร